카미야마 토우마=가면라이더 세이버를 위시한 검사들이, 그 목숨을 걸고 세계를 구한 뒤로 8년의 세월이 흘렀다. 토우마는 절친 마미야나 담당 편집자 스도 메이의 도움도 받아가며, 과거 검사들의 싸움에 휘말려 부모를 잃은 소년 리쿠와 함께 지내고 있었다. 그는 리쿠의 아버지를 대신하고자 마음먹고 있었지만, 리쿠의 마음의 상처는 낫지 않고, 11살이 된 지금도 미소를 보이는 일은 없었다. 한편, 번역가가 된 후카미야 켄토는 타치바나 유이나라는 여성과 결혼을 앞두고 충실한 나날을 보내고 있었다.

소설을 집필하는 데 슬럼프를 겪는 ‘서인화(가면라이더 세이버)’는 우연히 ‘유리(가면라이더 최광)’가 추천한 책을 읽는다. 그런데 책을 펼치는 순간 빛에 휩싸이더니 인간과 기계가 공존하는 파워레인저 세계에 도착하고, 그곳에서 ‘전려욱(파워레인저 젠카이저)’을 만나게 된다. 한편, 여러 세계가 뒤섞이면서 멀티버스의 모든 히어로가 소멸되기 시작하고, 히어로들은 이 모든 것이 누군가의 음모일지 모른다는 불길한 예감에 사로잡힌다. 그리고 사건의 열쇠를 쥔 소년과의 만남이 시작되는데...! 모든 것을 제자리로 돌려놓기 위한 역대 가면라이더 X 파워레인저의 마지막 대전쟁이 시작된다!

잇키는 '행복탕' 에서 오래된 우표가 들어있는 분실물을 줍는다. 그 분실물의 주인인 모모세 히데오에게 전해주러 가는 도중에 잇키는 강력한 적에게 습격당하고 바이스와 변신해서 싸우는 잇키의 위험에 도우러온 소설가 카미야마 토우마와 함께 싸우지만 둘은 고전. 거기에 2071년의 미래로부터 갑자기 찾아온 가면라이더 센츄리의 공격까지 받게된다. 센츄리는 누구인가? 왜 가면라이더를 공격하는가? 그리고 이야기의 열쇠를 가지고 있는 수수께끼의 과학자 모모세 류노스케에 의해 밝혀진 가면라이더 사상 최대의 비밀!

성검으로 뽑힌 검사들 '소드 오브 로고스' 앞에 압도적인 힘을 가진 바하트/가면라이더 팔시온이 나타난다. 봉인돼 있어야 할 파멸의 책들이 바하트에 의해 해방되고, 책에서 쏟아진 어둠에 의해 현실 세계와 원더 월드가 삼켜져 간다. 종말을 향한 운명을 앞두고 토우마는 소드 오브 로고스 동료들과 함께 바하트와의 결전에 도전한다.