아름다운 보석의 나라 "크리스탈리아"가 어둠의 제국 "요돈헤임"에게 침략당했다. 크리스탈리아의 왕녀는 신비한 힘을 가진 5개의 보석 "키라메이 스톤"과 함께 지구로 향한다. 키라메이 스톤과 공명해 반짝이는 정신 "키라멘탈"을 가진 5인의 전사를 찾는다. 요돈군이 지구의 침략을 시작하지만, 드디어 5인의 전사가 모였다! 사람이 반짝이는 순간, 그곳에 기적이 일어난다! 반짝임, 그것은 미래를 바꾸는 전사의 증표! 마진전대 키라메이저! 세계를 어둠으로 물들이려는 요돈군으로부터 사람들의 미소를, 희망을, 빛을 지켜라!

위험천만한 삶에서 수년 전 발을 뺀 닌자 일가. 하지만 심상치 않은 일련의 위협에 대응하기 위해, 삐걱대는 가족 관계 속에서 다시 어둠의 임무로 복귀한다.

쇼난 바다와 가까운 상점가에 사는 치요미는 소꿉친구이자 농구계 스타인 미나미를 좋아한다. 어느 날, 치요미는 미나미와 약속한 장소로 향하지만, 아무리 기다려도 그가 나타나지 않는다.

우수한 과학자로 오토바이 레이서이기도 한 혼고 타케시는, 그 능력에 주목한 악의 비밀 결사 쇼커에 납치되어 메뚜기의 능력을 가진 개조 인간(사이보그의 일종)이 되어 버렸다. 그러나, 뇌수술에 의해 그 의사를 빼앗기기 직전, 쇼커의 협력자로 되고 있었던 은사인 미도리카와 박사의 안내로 탈출에 성공했다. 미도리카와 박사는 탈출의 도중에 쇼커의 괴인·거미남자에게 암살되지만, 그 유지를 이어받은 다케시는 허리에 찬 벨트 풍차 발전기에 바람의 에너지를 받아 변신, 쇼커에 직면한다.