국민적 인기 만화를 원작으로 한 TV애니메이션의 극장판.카메유에 출현한 수수께끼의 폭탄범을 둘러싸고, 친숙한 료씨들 파출소 멤버의 활약을 그린다. 토모사카 리에가 소리를 연기한 폭탄 처리반등의 신캐릭터에 가세해, 전대미문의 료씨가 영화판만이 가능한 스케일로 대활약. 친숙한 아사쿠사를 시작해 우에노, 긴자와 실제의 거리풍경을 구현한 미술도 볼거리. 시나다 토라조가 경영하는 시나트라 호텔, 고문 변호사 마틴이 인솔하는 시나트라 상회의 악취미한 빌딩이 연달아 폭파되었다.범인은, 변천소승이라고 자칭하는 수수께끼의 폭탄 프로. 쿠즈사에는 FBI에서 폭탄처리 전문가 호시노리사와 파트너 로봇 댄디가 파견된다. 마지못해 리사와 콤비를 이뤄 수사에 임하는 료우츠.그런 때, 칡장수에게 벤텐코조로부터 새로운 범행 예고가 온다.

어느 비오는 날 밤, 학원제 준비를 위해 학교에 남아있던 사토시와 친구들은 곧 전학가는 마유가 마음에 걸려 쉽사리 정리를 끝마치지 못하고 있었다. 그때 오컬트를 좋아하는 아유미가 '행복한 사치코씨'를 하면 모두가 평생 함께 있을 수 있다는 얘기를 꺼내고 전학가는 마유를 위해 '행복한 사치코씨'를 하게 되는데..

U.C.0097. ‘라플라스의 상자’가 열린 지 1년. 뉴타입의 존재와 그 권리에 언급된 ‘우주세기 헌장’의 존재가 밝혀졌어도 세상의 틀은 크게 변화되지 않았다. 후에 ‘라플라스 사변’이라고 불리는 전란은 네오 지온의 잔당군 ‘소데츠키’가 와해되며 종결된 것으로 보였다. 그 최후의 전투에서 2기의 풀 사이코 프레임 사양의 모빌 수트가 인지를 초월한 힘을 보였다. 하얀 유니콘과 검은 사자. 2기의 위협은 봉인됨으로써 사람들의 의식에서 멀어져 갔고 기억에서 사라질 예정이었다. 하지만 2년 전에 행방불명 된 RX-0 유니콘 건담 3호기가 지구권에 다시 모습을 드러내기 시작했다. 금빛 ’불사조’, 그 이름은 페넥스.

"저주받은 주문 「행복의 사치코 씨」를 통해 원혼이 봉해진 이공간으로 보내졌던 여고생 나오미는 그곳에서 소꿉친구인 사토시와 세이코 등 많은 친구를 잃었다. 그로부터 6개월 후 살아남은 나오미와 아유미는 원래의 생활을 되찾았지만, 친구들을 그리워한다. 어느 날 아유미는 나오미에게 모두를 되돌릴 방법이 있다고 이야기한다. 단 한 번 시간을 거슬러 그 당시로 돌아가는 방법, 이를 통해 두 사람은 죽은 친구들을 되살리기 위해 비극의 무대였던 천신 초등학교로 돌아간다. 그곳에서 같은 주문으로 갇히게 된 다른 학교 학생들과 합류하며, 간절한 마음으로 돌아갈 방법을 찾는다. 하지만 그들을 기다리고 있던 것은, 돌이킬 수 없는 「죽음의 운명」에 갇힌 친구들과의 재회였다. 그리고 돌이킬 수 없는 참극에서 아유미를 구하기 위해 언니 히노에가 천신 초등학교를 향하게 된다. 목숨과 마음을 농락하는 잔혹한 운명의 톱니바퀴는 여전히 천천히 돌아가고 있었다."