감옥에서 풀려난 이후, '고구마'는 바닷가 근처에서 작은 점포를 운영하며 살아가고 있다. 수입은 적지만 누가 뭐라해도 자신의 삶에 만족하고 있다. 그러던 어느 날, 그는 자신이 생전 만나본 적도 없는 그의 오랜 "보스"와 빚만 떠너긴 어머니, 그리고 친구 '마오자'가 삶에 침투하면서 그는 과거의 소용돌이에 빠지게 된다. 그들은 그의 현재 삶을 하나씩 무너뜨리며 미래에 대한 희망마저 빼앗아간다. 이런 상황에서도 '세븐'만이 그의 불안을 달래주는 유일한 존재가 된다. 어느 날, 짙은 안개 속 답답하기만한 바닷가에서 '고구마'는 마침내 "보스"와 만남을 갖게 되는데...

뤄홍우(황각)는 아버지의 부고를 듣고 장례식에 참석하기 위해 고향 카이리를 찾는다. 돌아온 고향에서 그는 아버지의 고장난 시계에서 얼굴이 잘려나간 어머니의 사진과 함께 과거에 만났던 한 여인의 흔적을 발견한다. 그녀의 이름은 완치원(탕웨이). 뤄홍우는 현실인지 과거인지 꿈속인지 알 수 없는 시공간을 오가며 어머니와 관련된 과거, 그리고 알 수 없는 그녀와 함께한 여름에 대한 회상을 건져 올린다. 그녀를 통해 어머니를 만나고 이해하게 된 그는 그녀를 찾아 언제 끝날지 모르는 긴 여정을 시작한다.

어느 날 몸을 피해 잡화점에 숨어 들어온 3인조 좀도둑은 우연히 우체통을 통해 편지를 받게 된다. 장난스레 편지에 답장을 하던 이들은 그 편지가 과거에서 보낸 편지라는 사실을 알게 되는데… 첫 번째 편지, 가수의 꿈을 이루기 위해 도시로 나갔지만 가수로서 재능이 보이지 않아 고민하는 ‘시골 뮤지션’이 보내는 편지. 두 번째 편지, 마이클 잭슨 같은 스타를 꿈꾸지만 아버지의 사업 실패와 순간의 실수 때문에 가족과 헤어져 보육원에서 자라난 ‘하오보’가 보내는 편지. 세 번째 편지, 가족을 부양하기 위해 큰돈을 벌고 싶은 ‘길 잃은 강아지’가 보내는 편지. 아무에게도 말하지 못했던 모두의 고민이 모여드는 “나미야 잡화점” 하룻밤 동안 펼쳐지는 가슴 따뜻한 이야기가 당신을 찾아갑니다.

어둠에 잠긴 디스토피아, 세 사람을 향한 한 남자의 복수. 수십 년 전, 그에게는 어떤 일이 일어났던 걸까. 과거로 거슬러가며 하나씩, 그 어긋난 순간들이 드러난다.

오래전, 대만을 떠나 미국으로 왔다. 그 길에서 사랑을 잃었다. 멀어진 딸에게 다가가며, 지난 기억을 되살리는 남자. 잔잔한 물결처럼, 그 마음에 회한이 일렁인다.

어린 시절 린거(리홍기)의 유일한 친구는 치우첸(이일동)이었다. 치우첸의 전학으로 헤어진 두 사람은 고등학교에서 재회하고 서로에게 호감을 느끼게 된다. 린거의 생일을 함께 보낸 그 날, 마음을 고백하려던 순간 교통사고로 치우첸을 잃고 만다. 절망에 빠진 린거는 그녀를 살려달라며 애원하고 기적처럼 시간을 되돌려 치우첸을 구한다. 하지만 손목시계의 신비한 힘을 빌린 대가로 존재하지 않는 사람이 된 린거는 모두의 기억에서 지워지는데… 어긋나버린 시간의 끝에서 두 사람은 다시 만날 수 있을까?

모두에게 친절한 인기 절정의 미소 천사 ‘시만’은 회사에서 포상휴가를 받아 핀란드로 단체 여행을 떠난다. 그러나 그곳에서 뜻밖의 사고를 당하게 되고, 과거에 대한 기억은 모두 잃은 채 자신을 구해준 동료 ‘페이리’와 하루 동안 데이트를 하게 된다. 섬세하고 다정한 너드남 ‘페이리’와 자신의 버킷리스트를 하나씩 채워가던 중, 다음 날이면 다시 과거의 기억을 되찾는 대신 ‘페이리’와 함께한 오늘을 전부 잊게 된다는 사실을 알게 되는데…