400년간 앙숙으로 지내온 이가 츠바가쿠레 부족과 코우가 부족. 두 일족은 특별한 능력을 지닌 닌자를 배출해온 시노비 일족들이다. 핫토리 한조의 부전(不戰)의 약정으로 인해 전쟁 없이 명맥을 이어오던 두 부족은 도쿠가와 이에야스의 후계자 결정에 휘말리면서 부전의 약정을 깨고 닌자의 인법을 사용하여 서로 전쟁을 시작한다. 한편 코우가의 차기 수장 겐노스케와 이가 츠바가쿠레의 차기 수장 오보로는 결혼을 약속한 사이이지만 두 부족 간의 전쟁이 시작되면서 두 사람의 관계는 한 치 앞을 내다볼 수 없는 운명의 소용돌이에 휘말리게 되는데…

울트라맨, 세븐, 잭, 에이스 울트라 형제는 초수 U킬러 사우루스의 지구 공격을 막고 그 강력한 에너지를 봉인하는 데 성공하지만, 20년 후 그들의 뜻을 이어받은 미라이-울트라맨 메비우스는 지구를 정복하려는 외계인 연합의 템페러 행성인의 도전을 받게 된다. 하지만 이를 물리치고...

4년 전에 사고로 양친을 잃고 친구 미키의 집에 얹혀살고 있는 후도 아키라. 어느날 둘도 없는 친구인 료를 따라 료의 아버지인 아스카 박사의 연구자료를 찾는다. 하지만 아스카 박사가 각성시킨 사악한 생명체 '데몬'에 의해 습격당해 몸을 지배받는 아키라와 료. 료는 완전히 데몬에게 지배당했지만 아키라는 강인한 정신력으로 버텨내 인간과 데몬의 중간적 존재인 '데빌맨'이 된다. 데빌맨이 된 아키라는 인류를 멸망시키려는 데몬족과 싸우기로 결심한다.

고요하고 평화로운 일본열도, 어느 날 원인 모를 대규모의 폭발이 산발적으로 발생한다. 국민들은 이 원인 모를 폭발에 불안과 공포를 느끼기 시작하고 일본열도는 금세 전쟁터를 방불케하는 혼란으로 휩싸인다. 이에 일본 항공 자위대는 비상소집을 갖고 대책회의를 세우고 폭발사건의 원인 규명에 나선다. 결국 사건의 주범이 일본 내에 주둔중인 미군기지의 미사일이었다는 것을 밝혀낸 자위대는 또한, 미군기지의 미사일 시스템은 '녹색 원숭이'라 불리우는 정체불명의 테러집단의 단원에 의해 조종되었다는 사실까지 알게 된다. 발사 시스템을 조작하여 미사일을 날려보낸 '녹색원숭이' 단원은 체포되었지만 그는 결국 여러 가지 의문만 남겨놓은 채 "녹색원숭이가 세상을 지배한다"라는 말만 남기고 자살을 하고 만다. 사건은 다시 원점으로 돌아가고 이에 자위대는 사건 해결을 위해 '천리안'으로 불리우는 외과의인 '유리 사치코'에게 사건을 의뢰한다. 앞으로 일어날 사건을 미리 볼 수 있는 능력과 사람의 마음을 모두 읽어내는 능력이 있는 그녀는 이전에도 '녹색원숭이'의 테러로부터 사람들을 구했던 경험이 있는 일본 국민들의 정신적인 지주로 자리잡고 있는 유명인이다. 또한 항공 자위대는 '유리'에게 도움을 줄 '미유키'라는 조종사를 선발하여 '유리'와 함께 사건의 해결에 총력을 다하게 한다. 대학 시절 심리학을 전공한 '미유키'는 점점 '유리'의 불가사의한 능력에 감탄하며 그녀를 존경하게 되고...