더블과 디케이드, 두 사람의 가면라이더가 자신들의 운명에 정면으로 마주했을때 싸움은 새로운 스테이지로 이끌려진다! 대쇼커를 능가하는 적, 슈퍼쇼커의 야망! 소중한 추억을 밟아뭉개는 도펀트! 더욱이 거대요새 메카이자와 박력의 배틀을 펼치는 리볼개리등, 머신대전도 발발! 헤이세이의 가면라이더들도 대참전하고, 궁극의 생명체 얼티밋 D와의 결전에 돌입해간다!! 보라, 최강의 파이널 폼 라이드를!!

카도야 츠카사=가면라이더 디케이드가 방문한 어떤 세계. 그곳에서는 왠지 츠카사가 찍은 사진이 예전과는 달리 정상적으로 나오고 있었다. 츠카사가 몇 안 되는 기억을 의지하여 어떤 양옥에 간신히 도착하자 그곳엔 츠카사의 여동생과 자칭하는 소녀 카도야 사요가 있었으며 츠카사는 여기가 자신의 세계라고 확신한다. 그러나 이 세계에서도 세계의 붕괴는 진행되고 있었다. 사요를 시중드는 츠키카게 노부히코는 세계의 붕괴의 원인이 각 세계에서 태어난 라이더들에게 있다고 하여 그것을 멈추기 위해서는 최강의 라이더를 단 1명 결정하지 않으면 안된다고 말한다. 그 말을 들은 츠카사는 「라이더 토너먼트」의 개최를 결정한다. 각 세계를 여행한 츠카사가 중개가 되어 잇달아 집결해 싸우는 라이더들. 그러나 그 싸움의 뒤에는 각 세계의 악의 조직에 의해 구성된 조직 「대쇼커」의 음모가 숨겨져 있었다. 「라이더 토너먼트」의 결착과 함께 사와 츠키카게의 거동이 수상해져 회장이 붕괴. 기절한 유스케와 나츠미는 대쇼커의 본부로 데리고 가져 버린다. 나츠미를 쫓아 온 에이지로는 갑자기 대쇼커의 대간부인 사신박사로 변신하고 그 상황에 한층 더 츠카사가 나타나 자신의 진짜 정체를 드러낸다. 츠카사는 대쇼커의 대수령이며 「라이더 토벌」이 그의 진정한 목적이었던 것이다.

영원불멸의 마력을 지닌 신비한 존재 ‘오니’의 신부가 될 운명을 거부하는 비운의 소녀 모에기, 그리고 그를 영원의 신부로 맞이하고자 하는 ‘오니’ 레이지의 아름다운 러브 판타지.

2009년, 세계 각지에서 테러가 다발. 일본정부는 대 테러조직으로 쉐이드를 창설. 여러 분야의 정예가 모여, 상당한 효과를 올렸다. 그러나, 인간을 세뇌하고 육체를 병기화 하는 개조실험이 발각되어 조직은 해산, 그 조직의 창시자인 도쿠가와 세이잔도 체포되었다. 그리고 창설 50주년 행사가 진행되고 있는 TV 아사히 방송국에 쉐이드가 침입, 200여명을 인질로 잡고 생방송중인 스튜디오에서 인질과 도쿠가와 세이쟌의 교환을 일본정부에게 요청하는데...