어느 날, 지구에 떨어진 정체불명의 거대물체! 그로 인해 토큐저의 기술과 무기는 악당들에게 통하지 않게 되고 설상가상, 어린 아이의 모습으로 변해버리고 만다. 지구를 구할 수 있는 시간은 단 하루 뿐! 토큐저와 쿄류저는 힘을 모으기로 결심하는데... 과연, 최강의 악당에 맞선 두 히어로들은 지구를 구해낼 수 있을 것인가?!

타임 재커의 역사 개입으로 세계는 휴머기어에 인간이 지배되는 구도로 바뀌고 만다. 히덴 아루토는 황폐한 세계에 당혹감을 숨길 수 없지만, 거기에 추격을 가하듯이 휴마기어 윌 / 어나더 제로원의 존재에 의해서 제로원의 힘이 없어지고 만다. 원래의 세계를 되찾기 위해 가면라이더로서의 기억이 되살아난 토기와 소고와 함께, 아루토는 모든 것의 시작일인 12년 전으로 향한다. 그러나, 그런 아루토 앞에, 12년 전의 큰 사고 「데이 브레이크」에 휘말려 목숨을 잃었을 아버지 · 히덴 소레오가 나타난다.